Evren kuşatma altında. Her elli bin yılda bir, akıllı makinelerden meydana gelen bir ırk galaksimizi işgal ediyor ve tüm organik canlıları hasat ediyor. Bunlar Reaperlar.
Bu durumun farkında olan iki kişi, Amiral David Anderson ve Kahlee Sanders, bu döngüye engel olmanın bir yolunu bulmaya çabalıyorlar. Reaper tehdidinin gerçek olduğuna dair ürkütücü kanıtlar da elde ettiler. Ancak hedeflerine ulaşmaya çalışırken, gizli bir organizasyon olan Cerberus ve bu organizasyonun gizemli lideri Asılsız Adam’ın entrikalarının da ortaya çıkmasına neden oldular. Bu durum da David ve Kahlee’nin hayati bir tehlikeye maruz kalmasına yol açtı, çünkü Cerberus, sırlarının ifşa olmaması için her şeyi yapabilecek bir örgüt.
Bütün bunlar olup biterken, David ve Kahlee sıra dışı güçleri olan genç bir kadınla, yani Gillian Grayson’la tanıştı. Dehşet verici bazı bilimsel deneylerin sona ermesinin ardından Gillian en sonunda özgürlüğüne kavuştu ve ölümcül güçlerini kullanmaya başlıyor. Ancak babasının ölümünden Cerberus’un sorumlu olduğunu öğrendikten sonra Cerberus ve Asılsız Adam’dan intikam almaya yemin eden Gillian, Anderson ve Kahlee’nin uğruna savaştığı her şeyin mahvolmasına neden olabilir.